グラフィカルモデル

グラフィカルモデル (graphical model)†

確率変数をノードとし，確率変数間に統計的な依存関係を有向辺で表したグラフを考える．このグラフに基づいて，複数の確率変数の同時確率や条件付き確率を扱うためのモデル．

--しましま

関連項目†

• graphical model
   
• ベイズ推定
• ベイジアンネット
• Markov確率場
• 確率伝播
• ジャンクションツリー
• MCMC
• 平均場近似
• 変分ベイズ
• グラフ
   
• 検索: グラフィカルモデル

リンク集†

• probabilistic-programming.org：グラフィカルモデルで記述したモデルの推論エンジンのまとめ
• A Brief Introduction to Graphical Models and Bayesian Networks @ Kevin Murphy
   
• Wikipedia:Graphical_model

Freeware†

• mloss:bayesian-networks, mloss:markov-random-fields, mloss:crf, mloss:naive-bayes,-mloss:bayesian-networks
• Software Packages for Graphical Models / Bayesian Networks
• R
  • Bayesian Inference@ CRAN Task View：統計処理ソフト R の関連パッケージまとめ
  • gRaphical Models in RV @ CRAN Task View：統計処理ソフト R の関連パッケージまとめ
  • RjpWiki:R とベイズ
  • RjpWiki:Rでベイズ統計学

個別

• Banjo: Bayesian Network Inference with Java Objects
• Bayes++：KalmanフィルタなどのBayesianフィルタリング (C++)
• Bayesian inference Using Gibbs Sampling(BUGS)：MCMCでベイズ分析をするソフト
• Bayesian Logistic Regression
• Bayes Net Toolbox for Matlab @ Kevin Murphy
• BiiPS：逐次モンテカルロによるベイズ推定
• Bishop (Bayesian classifier library for the Ruby)
• BNJ (Bayesian Network tools in Java)
• FastInf：高速近似推論ライブラリ
• GMMBAYES - Gaussian Mixture Model Methods：混合分布とベイズ分類 (matlab)
• The Graphical Models Toolkit (GMTK)
• HBC (Hierarchical Bayes Compiler)：モデルを書いたら C や java のコードに変換
• Infer.Net Microsoft Research 謹製 .NET 用
• javaBayes @ © Fabio Gagliardi Cozman
• jBNC：ベイジアンネットライブラリ (java, Weka)
• Bayesian Network Classifier Toolbox：Wekaでも使える
• JAGS：MCMCによる推論 (java)
• JCAT (Java Causal Analysis Tool)
• libDAI C++
• Libra：いくつかのサンプリング系の手法で推論
• OpenBUGS：MCMCによる推論
• OpenGM (C++)
• pebl：Python Environment For Bayesian Learning
• PNL：グラフィカルモデル (matlab)
• Reverend：ベイズ識別器
• ReBEL：Recursive Bayesian Estimation Library (matlab)
• SamIam：ベイジアンネットのモデリングツール (java)
• SMILE&GeNIe グラフィカルモデル (C++)
• Software Packages for Graphical Models / Bayesian Networks
• Stan：MCMCによる推論 (R, C++)
• VIBES：ベイジアンネットを変分推論

関連文献†

• Book/Pattern Recognition and Machine Learning 8章：グラフィカルモデルがサンプルとして公開されている．
• Book/Probabilistic Graphical Models：定番本
• Martin J. Wainwright and Michael I. Jordan "Graphical Models, Exponential Families, and Variational Inference", Foundations and Trends in Machine Learning, vol.1, pp.1-305 (2008)：無料公開

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