*グラフィカルモデル (graphical model) [#zb76c630]
確率変数をノードとし，確率変数間に統計的な依存関係を有向辺で表したグラフを考える．このグラフに基づいて，複数の確率変数の同時確率や条件付き確率を扱うためのモデル．
> --しましま
**関連項目 [#o3dce210]
-[[graphical model]]
#br
-[[ベイズ推定]]
-[[ベイジアンネット]]
-[[Markov確率場]]
-[[確率伝播]]
-[[ジャンクションツリー]]
-[[MCMC]]
-[[平均場近似]]
-[[変分ベイズ]]
-[[グラフ]]
#br
-[[検索: グラフィカルモデル]]
** リンク集 [#u68c3421]
-[[probabilistic-programming.org>http://probabilistic-programming.org]]：グラフィカルモデルで記述したモデルの推論エンジンのまとめ
-[[A Brief Introduction to Graphical Models and Bayesian Networks>http://www.cs.ubc.ca/~murphyk/Bayes/bayes.html]] @ Kevin Murphy
#br
-[[Wikipedia:Graphical_model]]
*** Freeware [#dd779f11]
-[[mloss:bayesian-networks]], [[mloss:markov-random-fields]], [[mloss:crf]], [[mloss:naive-bayes]],-[[mloss:bayesian-networks]]
-[[Software Packages for Graphical Models / Bayesian Networks>http://www.cs.ubc.ca/~murphyk/Bayes/bnsoft.html]]
-[[R]]
--[[Bayesian Inference@ CRAN Task View>http://cran.r-project.org/web/views/Bayesian.html]]：統計処理ソフト [[R]] の関連パッケージまとめ
--[[gRaphical Models in RV @ CRAN Task View>http://cran.r-project.org/web/views/gR.html]]：統計処理ソフト [[R]] の関連パッケージまとめ
--[[RjpWiki:R とベイズ]]
--[[RjpWiki:Rでベイズ統計学]]
個別
-[[Banjo: Bayesian Network Inference with Java Objects>http://www.cs.duke.edu/~amink/software/banjo/]]
-[[Bayes++>http://bayesclasses.sourceforge.net/Bayes++.html]]：KalmanフィルタなどのBayesianフィルタリング (C++)
-[[Bayesian inference Using Gibbs Sampling(BUGS)>http://www.mrc-bsu.cam.ac.uk/bugs/]]：[[MCMC]]でベイズ分析をするソフト
-[[Bayesian Logistic Regression>http://www.bayesianregression.org/]]
-[[Bayes Net Toolbox for Matlab>http://bnt.sourceforge.net/]] @ Kevin Murphy
-[[BiiPS>http://alea.bordeaux.inria.fr/biips/doku.php?id=home]]：逐次モンテカルロによるベイズ推定
-[[Bishop (Bayesian classifier library for the Ruby)>http://bishop.rubyforge.org/]]
-[[BNJ (Bayesian Network tools in Java)>http://bnj.sourceforge.net/]]
-[[FastInf>http://compbio.cs.huji.ac.il/FastInf]]：高速近似推論ライブラリ
-[[GMMBAYES - Gaussian Mixture Model Methods>http://www.it.lut.fi/project/gmmbayes/]]：混合分布とベイズ分類 (matlab)
-[[The Graphical Models Toolkit (GMTK)>http://ssli.ee.washington.edu/~bilmes/gmtk/]]
-[[HBC (Hierarchical Bayes Compiler)>http://www.cs.utah.edu/~hal/HBC/]]：モデルを書いたら C や java のコードに変換
-[[Infer.Net>http://research.microsoft.com/en-us/um/cambridge/projects/infernet/]] Microsoft Research 謹製 .NET 用
-[[javaBayes>http://www.cs.cmu.edu/~javabayes/Home/]] @ © Fabio Gagliardi Cozman
-[[jBNC>http://jbnc.sourceforge.net/]]：ベイジアンネットライブラリ (java, [[Weka]])
-[[Bayesian Network Classifier Toolbox>http://jbnc.sourceforge.net/]]：[[Weka]]でも使える
-[[JAGS>http://www-fis.iarc.fr/~martyn/software/jags/]]：MCMCによる推論 (java)
-[[JCAT (Java Causal Analysis Tool)>http://www.uncertainreasoning.com/]]
-[[libDAI>http://www.libdai.org/]] C++
-[[Libra>http://libra.cs.uoregon.edu/]]：いくつかのサンプリング系の手法で推論
-[[OpenBUGS>http://www.openbugs.info/]]：MCMCによる推論
-[[OpenGM>http://hci.iwr.uni-heidelberg.de/MIP/Software/opengm.php]] (C++)
-[[pebl>http://code.google.com/p/pebl-project/]]：Python Environment For Bayesian Learning
-[[PNL>http://sourceforge.net/projects/openpnl/]]：グラフィカルモデル (matlab)
-[[Reverend>http://sourceforge.net/projects/reverend/]]：ベイズ識別器
-[[ReBEL>http://choosh.csee.ogi.edu/rebel/]]：Recursive Bayesian Estimation Library (matlab)
-[[SamIam>http://reasoning.cs.ucla.edu/samiam/]]：ベイジアンネットのモデリングツール (java)
-[[SMILE&GeNIe>http://genie.sis.pitt.edu/]] グラフィカルモデル (C++)
-[[Software Packages for Graphical Models / Bayesian Networks>http://www.cs.ubc.ca/~murphyk/Bayes/bnsoft.html]]
-[[Stan>http://mc-stan.org/]]：MCMCによる推論 (R, C++)
-[[VIBES>http://vibes.sourceforge.net/]]：ベイジアンネットを変分推論
** 関連文献 [#rd0bb364]
-[[Book/Pattern Recognition and Machine Learning]] 8章：グラフィカルモデルがサンプルとして公開されている．
-[[Book/Probabilistic Graphical Models]]：定番本
-[[Martin J. Wainwright and Michael I. Jordan "Graphical Models, Exponential Families, and Variational Inference", Foundations and Trends in Machine Learning, vol.1, pp.1-305 (2008)>http://dx.doi.org/10.1561/2200000001]]：無料公開
![[PukiWiki]](image/ibisforest.png "[PukiWiki]")
