グラフィカルモデル

グラフィカルモデル (graphical model) †

確率変数をノードとし，確率変数間に統計的な依存関係を有効辺で表したグラフを考える．このグラフに基づいて，複数の確率変数の結合確率や条件付確率を扱うためのモデル．

--しましま

関連項目 †

• graphical model
   
• ベイズ推定
• ベイジアンネット
• Markov確率場
• 確率伝播?
• ジャンクションツリー?
• MCMC
• 平均場近似
• 変分ベイズ
• グラフ
   
• 検索: グラフィカルモデル

リンク集 †

• A Brief Introduction to Graphical Models and Bayesian Networks @ Kevin Murphy
   
• Wikipedia:Graphical_model

Freeware †

• mloss:bayesian-networks, mloss:markov-random-fields, mloss:crf, mloss:naive-bayes,-mloss:bayesian-networks
• Software Packages for Graphical Models / Bayesian Networks
• R
  • Bayesian Inference@ CRAN Task View：統計処理ソフト R の関連パッケージまとめ
  • gRaphical Models in RV @ CRAN Task View：統計処理ソフト R の関連パッケージまとめ
  • RjpWiki:R とベイズ
  • RjpWiki:Rでベイズ統計学

個別

• Banjo: Bayesian Network Inference with Java Objects
• Bayes++：KalmanフィルタなどのBayesianフィルタリング (C++)
• Bayesian inference Using Gibbs Sampling(BUGS)：MCMCでベイズ分析をするソフト
• Bayesian Logistic Regression
• Bayes Net Toolbox for Matlab @ Kevin Murphy
• Bishop (Bayesian classifier library for the Ruby)
• BNJ (Bayesian Network tools in Java)
• FastInf：高速近似推論ライブラリ
• GMMBAYES - Gaussian Mixture Model Methods：混合分布とベイズ分類 (matlab)
• The Graphical Models Toolkit (GMTK)
• HBC (Hierarchical Bayes Compiler)：階層ベイズ (haskell)
• javaBayes @ © Fabio Gagliardi Cozman
• jBNC：ベイジアンネットライブラリ (java, Weka)
• Bayesian Network Classifier Toolbox：Wekaでも使える
• JAGS：MCMCによる推論 (java)
• JCAT (Java Causal Analysis Tool)
• libDAI：グラフィカルモデルの推論 (c++/matlab)
• OpenBUGS：MCMCによる推論
• pebl：Python Environment For Bayesian Learning
• PNL：グラフィカルモデル (matlab)
• Reverend：ベイズ識別器
• ReBEL：Recursive Bayesian Estimation Library (matlab)
• SMILE&GeNIe グラフィカルモデル (C++)
• Software Packages for Graphical Models / Bayesian Networks
• VIBES：ベイジアンネットを変分推論

関連文献 †

• Book/Pattern Recognition and Machine Learning 8章：グラフィカルモデルがサンプルとして公開されている．
• Book/Probabilistic Graphical Models：定番本
• Martin J. Wainwright and Michael I. Jordan "Graphical Models, Exponential Families, and Variational Inference", Foundations and Trends in Machine Learning, vol.1, pp.1-305 (2008)：無料公開